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Martín González, NataliaAutor o CoautorHernando-Perez MAutor o CoautorPérez-Illana MAutor o CoautorDe Pablo PjAutor o Coautor

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20 de agosto de 2019
Publicaciones
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Artículo

Adenovirus major core protein condenses DNA in clusters and bundles, modulating genome release and capsid internal pressure

Publicado en: NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 47 (17): 9231-9242 - 2019-09-26 47(17), DOI: 10.1093/nar/gkz687

Autores:

Martín-González, N; Hernando-Pérez, M; Condezo, GN; Pérez-Illana, M; Siber, A; Reguera, D; Ostapchuk, P; Hearing, P; San Martín, C; de Pablo, PJ
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Afiliaciones

CSIC, CNB, Dept Macromol Struct, E-28049 Madrid, Spain - Autor o Coautor
Departament de Física de la Matèria Condensada, Facultat de Física, Universitat de Barcelona, Martí i Franqués 1, 08028 Barcelona, Spain - Autor o Coautor
Department of Condensed Matter Physics, Universidad Autónoma de Madrid, Madrid 28049, Spain - Autor o Coautor
Department of Macromolecular Structures, Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC), Madrid 28049, Spain - Autor o Coautor
Department of Molecular Genetics and Microbiology, School of Medicine, Stony Brook University, Stony Brook, NY 11794-5222, USA - Autor o Coautor
Inst Phys, Zagreb, Croatia - Autor o Coautor
Institute of Physics, Zagreb, Croatia - Autor o Coautor
Instituto de Física de la Materia Condensada (IFIMAC), Universidad Autónoma de Madrid, Madrid 28049, Spain - Autor o Coautor
SUNY Stony Brook, Sch Med, Dept Mol Genet & Microbiol, Stony Brook, NY 11794 USA - Autor o Coautor
UBICS, Barcelona 08028, Spain - Autor o Coautor
Univ Autonoma Madrid, Dept Condensed Matter Phys, E-28049 Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Autonoma Madrid, Inst Fis Mat Condensada IFIMAC, E-28049 Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Barcelona, Fac Fis, Dept Fis Mat Condensada, Marti & Franques 1, E-08028 Barcelona, Spain - Autor o Coautor
Universitat de Barcelona Institute of Complex Systems (UBICS), 08028 Barcelona, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Some viruses package dsDNA together with large amounts of positively charged proteins, thought to help condense the genome inside the capsid with no evidence. Further, this role is not clear because these viruses have typically lower packing fractions than viruses encapsidating naked dsDNA. In addition, it has recently been shown that the major adenovirus condensing protein (polypeptide VII) is dispensable for genome encapsidation. Here, we study the morphology and mechanics of adenovirus particles with (Ad5-wt) and without (Ad5-VII-) protein VII. Ad5-VII- particles are stiffer than Ad5-wt, but DNA-counterions revert this difference, indicating that VII screens repulsive DNA-DNA interactions. Consequently, its absence results in increased internal pressure. The core is slightly more ordered in the absence of VII and diffuses faster out of Ad5-VII- than Ad5-wt fractured particles. In Ad5-wt unpacked cores, dsDNA associates in bundles interspersed with VII-DNA clusters. These results indicate that protein VII condenses the adenovirus genome by combining direct clustering and promotion of bridging by other core proteins. This condensation modulates the virion internal pressure and DNA release from disrupted particles, which could be crucial to keep the genome protected inside the semi-disrupted capsid while traveling to the nuclear pore.© The Author(s) 2019. Published by Oxford University Press on behalf of Nucleic Acids Research.
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Palabras clave

AdenoviridaeArchitectureAtomic-force microscopyCapsid proteinsCryo-em structureDna, viralEntryGenome, viralHumansMaturationMechanical-propertiesParticlesRevealsTransitionViral core proteinsViral proteinsVirionVirusVirus assembly

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista NUCLEIC ACIDS RESEARCH debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2019, se encontraba en la posición 15/297, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Biochemistry & Molecular Biology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 1.02. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 13 Nov 2025)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.28 (fuente consultada: FECYT Mar 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2026-04-06, el siguiente número de citas:

  • WoS: 31
  • Scopus: 35
  • Europe PMC: 15
  • Google Scholar: 42
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-06:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 40.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 40 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 4.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 5 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://repositorio.uam.es/handle/10486/716038
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Croatia; United States of America.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (MARTIN GONZALEZ, NATALIA) y Último Autor (DE PABLO GOMEZ, PEDRO JOSE).

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Reconocimientos ligados al ítem

Spanish Ministry of Economy and Competitivity [FIS201789549-R; Maria de Maeztu Program for Units of Excellence in R&D MDM-2014-0377; and FIS2017-90701-REDT] and Human Frontiers Science Program [HFSPO RGP0012/2018] to P.J.P. Spanish State Research Agency and European Regional Development Fund [BFU2016-74868-P] and Spanish Ministry of Economy, Industry and Competitivity [BIO2015-68990-REDT, the Spanish Adenovirus Network, AdenoNet] to C.S.M. MINECO/FEDER, UE [FIS2015-67837-P] to D.R. National Institutes of Health [CA122677 and AI102577] to P.H. M.H.-P. is a recipient of a Juan de la Cierva postdoctoral contract funded by the Spanish Ministry of Economy and Competitivity. M.P.-I. holds a predoctoral fellowship funded by La Caixa Foundation. Funding for open access charge: Secretar ' ia de Estado de Investigacion, Desarrollo e Innovacion [FIS2017-89549-R].
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