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Análisis de autorías institucional

Mestre, MrAutor o CoautorRedrejo-Rodriguez, MAutor o Coautor
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Artículo

UG/Abi: a highly diverse family of prokaryotic reverse transcriptases associated with defense functions

Publicado en:NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 50 (11): gkac467-gkac467 - 2022-06-24 50(11), DOI: 10.1093/nar/gkac467

Autores: Rodriguez Mestre, Mario; Alex Gao, Linyi; Shah, Shiraz A; Lopez-Beltran, Adrian; Gonzalez-Delgado, Alejandro; Martinez-Abarca, Francisco; Iranzo, Jaime; Redrejo-Rodriguez, Modesto; Zhang, Feng; Toro, Nicolas

Afiliaciones

Copenhagen Univ Hosp, Copenhagen Prospect Studies Asthma Childhood, Ledreborg Alle 34, DK-2820 Gentofte, Denmark - Autor o Coautor
CSIC, Estn Expt Zaidin, Dept Soil Microbiol & Symbiot Syst, Struct Dynam & Funct Rhizobacterial Genomes,Grp E, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Harvard Univ, Cambridge, MA 02138 USA - Autor o Coautor
Howard Hughes Med Inst, Cambridge, MA USA - Autor o Coautor
Inst Invest Biorned Alberto Sols CSIC UAM, Madrid, Spain - Autor o Coautor
MIT, Broad Inst MIT & Harvard, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA - Autor o Coautor
MIT, Dept Biol Engn, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA - Autor o Coautor
MIT, Dept Brain & Cognit Sci, E25-618, Cambridge, MA 02139 USA - Autor o Coautor
MIT, McGovern Inst Brain Res, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA - Autor o Coautor
Univ Autonoma Madrid UAM, Dept Bioquim, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid UPM, Ctr Biotecnol & Genom Plantas, Inst Nacl Invest & Tecnol Agr & Alimentaria INIA, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Zaragoza, Inst Biocomputat & Phys Complex Syst BIFI, Zaragoza, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Reverse transcriptases (RTs) are enzymes capable of synthesizing DNA using RNA as a template. Within the last few years, a burst of research has led to the discovery of novel prokaryotic RTs with diverse antiviral properties, such as DRTs (Defense-associated RTs), which belong to the so-called group of unknown RTs (UG) and are closely related to the Abortive Infection system (Abi) RTs. In this work, we performed a systematic analysis of UG and Abi RTs, increasing the number of UG/Abi members up to 42 highly diverse groups, most of which are predicted to be functionally associated with other gene(s) or domain(s). Based on this information, we classified these systems into three major classes. In addition, we reveal that most of these groups are associated with defense functions and/or mobile genetic elements, and demonstrate the antiphage role of four novel groups. Besides, we highlight the presence of one of these systems in novel families of human gut viruses infecting members of the Bacteroidetes and Firmicutes phyla. This work lays the foundation for a comprehensive and unified understanding of these highly diverse RTs with enormous biotechnological potential.

Palabras clave
Abortive infectionBacterial retronsBacteriophageClassificationDependent dna-polymeraseEndonucleaseHumansIdentificationPredictionProkaryotic cellsResourceRnaRna-directed dna polymeraseVirionsViruses

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista NUCLEIC ACIDS RESEARCH debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2022, se encontraba en la posición 10/285, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Biochemistry & Molecular Biology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 3.56. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 3.2 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 6.55 (fuente consultada: Dimensions May 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-05-02, el siguiente número de citas:

  • WoS: 17
  • Scopus: 16
  • Europe PMC: 9
  • OpenCitations: 19
Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-05-02:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 42.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 42 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 9.05.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 15 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://repositorio.uam.es/handle/10486/714053
Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Denmark; United States of America.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (RODRIGUEZ MESTRE, MARIO) .